ก่อนเหตุการณ์ในเกม Majestic Four ได้สร้างโลกขึ้นมา ผู้ที่มีอำนาจมากที่สุดคือ Mitra ซึ่งเป็นผู้สร้างโลกและดวงจันทร์ด้วย จากนั้นพวกเขาก็ให้ชีวิตแก่สิ่งมีชีวิตที่เรียกว่า Rudra ซึ่งมีพลังจาก Guardian of Evolution, Gomorrah ซึ่งใช้ Eternal Engine เพื่ออำนวยความสะดวกให้กับสิ่งมีชีวิตใหม่

ทุก 4,000 ปีที่ผ่านมา Rudra ปรากฏขึ้นพร้อมกับการแข่งขันของตัวเองและการแข่งขันที่มาก่อนที่จะถูกทำลายหรือขับรถไปใกล้สูญพันธุ์ อดีต Rudras ได้กลายเป็นฟอสซิลที่นักโบราณคดีเรียกว่า Lago Stones ในช่วง Great Cycle ชาว Danans ประสบความสำเร็จโดย Merfolk, The Reptiles , the Giantsและในที่สุดโดยมนุษย์ [1]

ในช่วงเริ่มต้นของเกม เหลือเวลาอีกสิบห้าวันก่อนการมาของ Rudra ใหม่และจุดจบของมนุษยชาติจะเริ่มต้นขึ้น [1]ตัวละคร Sion, Surlent, Riza และ Dune ต่างก็ครอบครอง Jade ซึ่งเป็นสมบัติที่ค้นพบใน Lago Stones มีการเปิดเผยว่า Gomorrah ต้องการ Jades นอกเหนือจากสมบัติอื่นๆ เพื่อสร้าง Rudra ที่สมบูรณ์แบบ และอาวุธที่เรียกว่า Sodom จะทำลายทุกเผ่าพันธุ์ที่สืบเนื่องมาจากถ้ำบนดวงจันทร์

หลังจากที่ทั้ง Gomorrah และ Sodom ถูกขัดขวางโดย Jadebearers พวกเขารวมตัวกันและขึ้นเรือ Danan ที่รู้จักกันในชื่อ Ark เพื่อเดินทางไปยังดวงจันทร์และเผชิญหน้ากับ Mitra เมื่อเอาชนะเธอ Mitra ยกย่อง Jadebearers สำหรับความแข็งแกร่งของพวกเขาและเผยให้เห็นว่านานมาแล้ว Majestic Four เคยต่อสู้กับกองกำลังที่รู้จักกันในชื่อ Destroyers ซึ่งเป็นภัยคุกคามต่อโลก เมื่อ Majestic Four ชนะ Mitra รู้ว่าวันหนึ่ง Destroyers จะกลับมาและตัดสินใจที่จะเอาชนะพวกเขาด้วยการสร้างเผ่าพันธุ์ที่สมบูรณ์แบบผ่านการวิวัฒนาการในขณะที่ใช้วัฏจักร 4,000 ปีเพื่อแทนที่เผ่าพันธุ์ที่อ่อนแอด้วยเผ่าพันธุ์ที่แข็งแกร่งกว่า ในชั่วพริบตา Mitra ถ่ายทอดความรู้ของเธอเกี่ยวกับ Eternal Engine ไปยัง Dune และยังทิ้งภารกิจในการต่อสู้กับ Destroyers ให้กับเผ่าพันธุ์มนุษย์อีกด้วย

ระหว่างตอนจบปาร์ตี้จะกลับบ้านและสัมผัสกับภาพของโลกที่ถูกทำลายโดยเหล่า Destroyers ซึ่ง Dune ตีความว่าเป็นคำเตือนจาก Mitra เขาพิจารณาใช้ Eternal Engine เพื่อพัฒนามนุษยชาติ แต่ Jadebearers ตัดสินใจต่อต้านมัน ดังนั้นพวกเขาจึงไม่ทำซ้ำการกระทำของ Mitra และเลือกที่จะปล่อยให้เผ่าพันธุ์มนุษย์วิวัฒนาการตามธรรมชาติแทน